Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFF3Q07654 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TFF3Q07654 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms