Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG1Q06432 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms