Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNTN2Q02246 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms