Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK6Q00534 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms