Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GTF2BQ00403 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GTF2BQ00403 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms