Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VLDLRP98155 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VLDLRP98155 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms