Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKP1P63208 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SKP1P63208 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKP1P63208 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKP1P63208 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP1P63208 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKP1P63208 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms