Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPS29P62273 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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