Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF3P61204 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF3P61204 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms