Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP6P59044 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP6P59044 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms