Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CABP4P57796 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CABP4P57796 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CABP4P57796 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CABP4P57796 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CABP4P57796 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CABP4P57796 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CABP4P57796 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CABP4P57796 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CABP4P57796 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP4P57796 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP4P57796 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CABP4P57796 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms