Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF3P57682 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KLF3P57682 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KLF3P57682 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLF3P57682 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms