Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AFDNP55196 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AFDNP55196 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AFDNP55196 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
AFDNP55196 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AFDNP55196 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AFDNP55196 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AFDNP55196 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AFDNP55196 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFDNP55196 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFDNP55196 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFDNP55196 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFDNP55196 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFDNP55196 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFDNP55196 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFDNP55196 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AFDNP55196 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AFDNP55196 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AFDNP55196 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AFDNP55196 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms