Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERFP50548 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERFP50548 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERFP50548 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERFP50548 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms