Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTCFP49711 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTCFP49711 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTCFP49711 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTCFP49711 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTCFP49711 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTCFP49711 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTCFP49711 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTCFP49711 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTCFP49711 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTCFP49711 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms