Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POU3F4P49335 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms