Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDO2P48775 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TDO2P48775 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TDO2P48775 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TDO2P48775 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TDO2P48775 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms