Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX5P48382 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX5P48382 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX5P48382 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX5P48382 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms