Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCAMP43121 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCAMP43121 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCAMP43121 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCAMP43121 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCAMP43121 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCAMP43121 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCAMP43121 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCAMP43121 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCAMP43121 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCAMP43121 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms