Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOBEC1P41238 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOBEC1P41238 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms