Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEACAM3P40198 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEACAM3P40198 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms