Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHI3L1P36222 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms