Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP6P35125 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP6P35125 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP6P35125 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP6P35125 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP6P35125 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP6P35125 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP6P35125 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP6P35125 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP6P35125 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP6P35125 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP6P35125 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP6P35125 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP6P35125 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP6P35125 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP6P35125 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP6P35125 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP6P35125 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP6P35125 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms