Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 BACH1-AS1-202ENST00000615718 700 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL035658.1-201ENST00000415054 357 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 ASPA-202ENST00000456349 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 LYSMD2-203ENST00000558126 775 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC087235.1-201ENST00000538297 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 C4orf22-201ENST00000358105 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 TMEM161B-207ENST00000509387 963 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC007922.2-201ENST00000579049 281 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC026254.4-201ENST00000581118 454 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AP000350.5-201ENST00000609825 613 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 SPATA22-201ENST00000268981 1280 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 CENPS-201ENST00000309048 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AL355802.1-201ENST00000417591 990 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 AC087894.2-201ENST00000541797 462 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXD11P31277 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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