Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXC13P31276 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms