Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB2P29033 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB2P29033 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB2P29033 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms