Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHMLP26374 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHMLP26374 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHMLP26374 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHMLP26374 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms