Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA3P26006 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms