Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APCP25054 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APCP25054 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APCP25054 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APCP25054 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APCP25054 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APCP25054 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APCP25054 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APCP25054 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APCP25054 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APCP25054 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APCP25054 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APCP25054 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms