Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP2B4P23634 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP2B4P23634 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms