Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPRBP23467 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms