Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT1P21579 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT1P21579 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT1P21579 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT1P21579 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms