Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HNF1AP20823 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HNF1AP20823 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms