Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRHP20396 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRHP20396 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRHP20396 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRHP20396 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRHP20396 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRHP20396 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRHP20396 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms