Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD53P19397 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD53P19397 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD53P19397 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD53P19397 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD53P19397 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD53P19397 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD53P19397 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD53P19397 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD53P19397 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD53P19397 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD53P19397 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD53P19397 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CD53P19397 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms