Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRAP18433 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRAP18433 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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