Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMPD1P17405 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMPD1P17405 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMPD1P17405 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPD1P17405 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms