Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
EPCAMP16422 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EPCAMP16422 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms