Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA1P15085 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA1P15085 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA1P15085 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA1P15085 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA1P15085 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA1P15085 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPA1P15085 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPA1P15085 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPA1P15085 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPA1P15085 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms