Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TOP2AP11388 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TOP2AP11388 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms