Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TOP1P11387 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TOP1P11387 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms