Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG8P0DPA2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms