Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GIMD1P0DJR0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GIMD1P0DJR0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms