Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGAP02671 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
FGAP02671 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGAP02671 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGAP02671 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGAP02671 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGAP02671 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGAP02671 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms