Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIN3BO60391 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIN3BO60391 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms