Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CREB3O43889 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CREB3O43889 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CREB3O43889 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms