Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms