Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTATSF1O43719 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms