Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRC1O43663 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRC1O43663 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRC1O43663 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRC1O43663 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRC1O43663 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRC1O43663 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRC1O43663 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRC1O43663 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRC1O43663 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRC1O43663 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms