Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACOX3O15254 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACOX3O15254 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms